“乐器之王”这个称号，管风琴当仁不让。它拥有许多最高级的称号：体积最庞大、音量最大、音色变化最多、构造最复杂，同时也是造价最昂贵的乐器。

矗立于星海音乐厅交响乐演奏大厅的管风琴，由捷克Rieger-Kloss 公司于1998年安装，当时是中国大陆有史以来最大的管风琴。这架巨型管风琴重40吨、宽14米、高9米、深5米，是一台拥有四层手键盘，84个音栓，6360根音管的管风琴。它的音管既有金属管，也有木制管，最大的可让一个小孩钻过，最小的比筷子还细。

这架管风琴在1998年6月13日，即星海音乐厅落成首演之日首次被奏响，此后它成为中国最常被奏响、历经世界各地管风琴大师演奏次数最多的管风琴之一。

星海音乐厅又一“镇馆之宝”。羽管键琴是起源于15世纪的古老乐器，在形制上与现代的三角钢琴相似，但琴弦是用羽管拨奏而不是用琴槌敲击的，所以也称“拨弦古钢琴”。

星海音乐厅的这台双排键羽管键琴由世界著名羽管键琴制造商德国纽珀特（J.C.NEUPERT）公司制作，当时是中国第一台，造价将近50万元。目前，相同型号的羽管键琴在全国也仅有5台。

羽管键琴是还原十七、十八世纪西方皇家贵族音乐时，必须要使用到的音色独特的乐器。由于在国内拥有羽管键琴的演出场馆不多，所以有时候外地演出场馆也会向星海音乐厅借用。这台琴曾经最远被借到北京，当时为了保证运输的安全，请了专业的物流公司将琴运达北京，并购置了高额保险。

每用一次羽管键琴所需的调律费高达2000元。

除了有镇厅之宝巨型管风琴和羽管键琴外，星海音乐厅还配备了三台STEINWAY&SONS（斯坦威）、两台BOESENDORFER（贝森朵夫）、一台YAMAHA（雅马哈）九尺音乐会演奏级钢琴。此外还配备了一部进口音乐会演奏级竖琴，一部马林巴琴，一套5件式的高级定音鼓等各种乐器。这些乐器都存放在恒温恒湿的大型乐器陈列室和各个琴房里边。