乐团于1995年由时任柏林爱乐乐团首席小提琴家Rainer Kussmaul等柏林爱乐乐团音乐家成立。柏林爱乐巴洛克独奏家合奏团专注于演奏巴洛克时期作曲家的作品以及部分古典主义时期的作品，有着超凡演奏水准的音乐家们在共同理念的推动和长期合作的默契浸润下，使乐团成为了巴洛克音乐领域的权威。他们在Sony、DG、EMI等唱片公司录制了许多经典的唱片，赢得了包括2005年格莱美奖、两项德国回声古典音乐大奖在内的诸多奖项。柏林爱乐巴洛克独奏家合奏团也是柏林爱乐官方认可的几支柏林爱乐室内乐团之一。

2026年，柏林爱乐巴洛克独奏家合奏团将邀请柏林爱乐乐团小提琴第一首席诺亚·本迪克斯-巴尔格利、中提琴首席梅第扬担任独奏，与乐团展开“完全莫扎特”亚洲巡演。