台湾艺专(现为台湾艺术大学)国乐科，主修胡琴、笛子，师承董榕森、江永生。在校期间，即对指挥怀有浓厚兴趣，并经常博览各种有关指挥技术的书籍，又精研和声、曲式、对位等有关的音乐理论，且针对各知名指挥精研其技巧及精髓，获益良多；其指导的各级学校参加国乐合奏比赛，屡获台湾音乐比赛优等而初露头角。

郭君曾于1982年获颁文艺创作小型团体舞曲佳作奖；1984年任高雄市国乐团指挥至乐团转型为专业乐团；1986年荣膺高雄市颁发推行社教有功人员之奖励；1987年以《荷塘春晓》一曲荣获第二十三届文艺金像奖最佳作曲奖。

郭君自高雄市国乐团创团以来，一直在该团担任副指挥及乐队训练的工作，经常指挥乐团演出定期音乐会、小区音乐会及校园音乐会，为国乐推广工作扎下深厚的基础。自1997年起负责统筹高雄市国乐团附设青少年国乐团、市民乐团及Ⅱ团演出业务并担任指挥。

2010年7月，获财团法人高雄市爱乐文化艺术基金会董事会推选接任基金会副执行长，负责国乐团行政与指挥业务。

郭君在近年来除致力于训练并指挥乐团演出外，更致力于台湾本土音乐的发扬与创作，重要作品有《被遗忘的山中贵族》、《北管联奏》、《欢庆》(台湾区音乐比赛国、高中组指定曲)、《玉山歌诗》、丝竹室内乐《杨柳》、《排湾风情四幅》、《山林我的家》(扬琴合奏)、《台湾风采集》、四幕舞剧音乐─《猴王闹龙宫》、《结彩人间》、《将军令》等作品，并为大量的歌曲、器乐曲编写伴奏或改编。

郭君近三十年的乐团实务指挥工作，累积深厚的乐队指挥经验，其潇洒、激情的指挥魅力，往往为观众所痴迷，是南台湾令人印象深刻的指挥家之一。